آزمایشگاه دکتر مظفری در محله استادان تبریز و در خیابان دانشگاه واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند ساختمان بهاران و بیمارستان شهید مدنی و کلینیک گلگشت و بیمارستان امام رضا (ع) و آبرسان قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه مترو به این مکان، ایستگاه مترو دانشگاه و نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه بی آر تی کلانترکوچه می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.