آزمایشگاه شمس در محله حافظ ارومیه و در خیابان امام،خیابان سرداران،خیابان خان باباخان واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند بیمارستان تخصصی شهید عارفیان(نظامی) و هتل بین المللی پارک و بیمارستان مطهری و مهمانپذیر صفا و ساختمان پزشکان کسری قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس خیابان امام می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.