آزمایشگاه مرکزی در محله رستم حسین زابل و در خیابان مصطفی خمینی،خیابان موسوی واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند طهران پروتئین و بیمارستان امام خمینی و چاپخانه شهریار و بستنی و آبمیوه ارکیده و آنلاین موزیک(شیخ لنگی) قرار گرفته است.