آزمایشگاه ویروس شناسی خاورمیانه در محله نجات اللهی تهران و در خیابان طالقانی،خیابان سپهبد قرنی واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند داروخانه شبانه روزی ۱۳ آبان و مرکز واکسیناسیون بوستان هنرمندان ایرانشهر و داروخانه مرکزی جمعیت هلال احمر و بیمارستان فیروزگر و مرکز واکسیناسیون بیمارستان محب یاس قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه مترو به این مکان، ایستگاه مترو طالقانی و نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس ویلا می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.