آزمایشگاه پاتوبیولوژی دکتر شفقی در محله ظفر تهران و در خیابان ولیعصر،خیابان والی نژاد واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند بیمارستان شهید هاشمی نژاد و بیمارستان خاتم الانبیا (ص) و بوستان آب و آتش و پل طبیعت و بیمارستان فوق تخصصی ولیعصر فراجا قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس میدان ونک می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.