آزمایشگاه پاستور در محله ارام شیراز و در بلوار کریمخان زند واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند بیمارستان نمازی و باغ ارم و بیمارستان شهید دکتر فقیهی و مجتمع تجاری تفریحی زیتون فارس و هتل پارس قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه مترو به این مکان، ایستگاه مترو نمازی ورودی شمال شرقی و نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس هدایت می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.