امامزاده جعفر در محله گلبهار اصفهان و در میدان امام علی،خیابان هاتف واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند آزمایشگاه تشخیص طبی مهدیه و بیمارستان امیرالمومنین و گز کرمانی و میدان نقش جهان (شاه عباس) و کاخ عالی قاپو قرار گرفته است. همچنین در برنامه بلد کاربران امتیاز ۵ از ۵ را به این مکان داده‌اند.