بیمارستان دامپزشکی مهرگان در شهر جدید هشتگرد و در میدان بسیج واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند دادگستری هشتگرد و بوستان مادر و بیمارستان تامین اجتماعی و بیمارستان امام جعفر صادق (ع) ساوجبلاغ و اداره ثبت اسناد و املاک شهرستان ساوجبلاغ قرار گرفته است.