مسجد امام باقر ع در محله دانشگاه کرمان و در ب. امام خمینی واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند شهربازی کرمان و مسجدالرضا علیه السلام و دانشگاه شهید باهنر کرمان و بیمارستان افضلی پور و جایگاه CNG شهربازی قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس دانشگاه باهنر می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد. همچنین در برنامه بلد کاربران امتیاز ۵ از ۵ را به این مکان داده‌اند.