مسجد امام جعفر صادق در محله صادقیه تهران و در خیابان ستارخان،بلوار شهدای صادقیه واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند ورودی ۲ مترو طرشت و رستوران فست فود زیتون و مجتمع تجاری اداری گلدیس و بیمارستان تخصصی ابن‌سینا و درمانگاه شبانه‌روزی شهرداری منطقه ۵ تهران قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه مترو به این مکان، ایستگاه اتوبوس متروصادقیه و نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس فلکه دوم صادقیه میدان هفتم تیر می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد. همچنین در برنامه بلد کاربران امتیاز ۵ از ۵ را به این مکان داده‌اند.