مسجد امام حسین در شاهدشهر و در خیابان رسول اکرم واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند درمانگاه رسول اکرم و فروشگاه افق کوروش و کلانتری ۱۴ شاهد شهر و شهرداری شاهد شهر و مسجد جامع شاهد شهر قرار گرفته است.