مسجد امیرالمومنین در گزبرخوار و در بلوار شهدا،خیابان حافظ،خیابان فردوسی واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند بانک ملی و بانک صادرات و ماهی فروشی خلیج فارس و استخر صبا و کالای برق صغیر قرار گرفته است.