مسجد جامع کرج در محله اسلام آباد کرج و در بلوار جانبازان واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند پاساژ دانشکده و پمپ بنزین میدان کرج و بیمارستان امام خمینی و امامزاده حسن و کاروانسرای شاه عباسی قرار گرفته است.