مسجد حسینی در بجستان و در میدان آزادی،بلوار مطهری واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند مرکز تعویض پلاک و رستوران و هتل جواد و پلیس + 10 و فروشگاه افق کوروش و لوازم التحریر دانشجو/داعی قرار گرفته است.