مسجد کمر زرین در محله جوباره اصفهان و در خیابان پیر پینه دوز،خیابان کمرزرین واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند هتل سنتی طلوع خورشید و آزمایشگاه تشخیص طبی مهدیه و بیمارستان امیرالمومنین و بیمارستان خصوصی زهرای مرضیه و گز کرمانی قرار گرفته است. همچنین در برنامه بلد کاربران امتیاز ۵ از ۵ را به این مکان داده‌اند.