ایران اکواریوم در محله سلامت تهران و در کنار‌گذر نواب واقع شده است. از لحاظ موقعیت جغرافیایی این مکان در نزدیکی مراکزی مانند مرکزواکسیناسیون سلامت جامعه شهری اکبر آباد و مرکز واکسیناسیون مجموعه ورزشی الزهرا (بریانک) و بیمارستان شهید فهمیده و بیمارستان لقمان حکیم و پمپ بنزین اختصاصی ۱۱۱ قرار گرفته است. نزدیکترین ایستگاه مترو به این مکان، ایستگاه مترو کمیل و نزدیکترین ایستگاه اتوبوس به این مکان، ایستگاه اتوبوس صفدری می‌باشد که دسترسی به این مکان را برای کاربران حمل‌ونقل عمومی آسان می‌سازد.